리쌍 다운로드

두 개의 읽기 파일이 지정 되 면 minimap2는 각 파일에서 차례로 읽고 내부적으로 인터리브 스트림으로 병합 합니다. 두 개의 읽기는 입력 스트림에 인접해 있고 동일한 이름을 가진 경우 쌍으로 간주 됩니다 (있는 경우/[0-9] 접미사가 트림 된 경우). 단일 및 쌍 끝 읽기를 혼합할 수 있습니다. 본질적인 결함 및 가능한 Li 이온 확산 경로의 형성을 위한에 너 서 스를 계산 하기 위해, 꿀 꺽 패키지에 구현 된 고전적인 쌍의 잠재적 인 방법은 employed38 이었다. 이 방법은 이온 결정 격자의 고전적인 본 모델 설명에 기초한 다. 모든 시스템은 전자 전자의 반발력과 반 데르 발스 상호작용을 나타내는 단거리 반발력과 장거리 어트랙션으로 구성 된 이온 들 사이의 상호작용을 가진 결정성 고체로 취급 되었다. 짧은 범위 상호 작용은 버킹엄 잠재력을 사용 하 여 모델링 했다 (표 S2 참조). 시뮬레이션 상자와 그에 상응 하는 원자의 위치는 브로 덴 플레처-골드 Farb-산 노 (BFGS) algorithm39를 사용 하 여 완화 되었다. 모트-리틀턴 method40는 점 결함과 마이그레이션 이온에 대 한 격자 이완을 조사 하는 데 사용 되었습니다. 이는 결정 격자를 두 개의 동심 구형 영역으로 나누고, 여기서 내부 구형 영역 내의 이온 (> 700 이온의 순서에 따라)을 명시적으로 완화 하 여 결함을 바로 둘러싸고 있습니다. 모든 결함 계산은 640 원자를 포함 하는 완벽 한 2 × 2 × 2 슈퍼 셀을 사용 하 여 수행 하였다. Li 이온 확산은 초기 및 최종 구성으로 2 개의 인접 한 공석 사이트를 고려 하 여 계산 되었다. 7 개의 간 질 리 이온은 직접 선형 경로에서 고려 되었고, 다른 모든 이온 들이 자유롭게 쉴 수 있는 동안 고정 되었습니다.

이 확산 경로를 따라 로컬 최대 에너지가 계산 되 고 활성화 에너지로 보고 됩니다. 본 모델은 희석 한계에 상응 하는 계산을 통해 완전 충전 된 이온 모델을 가정 하 고, 결함 반응과과 대 추정 되지만, 상대적 에너지와 경향은 일관성이 있을 것 이다. Li5FeO4의 결정 구조는 사방 정계 대칭 (스페이스 그룹 Pbca)과 결함 소포 구조를 나타낸다. 실험적으로 결정 된 격자 매개 변수는 다음과 같습니다: a = 9.218, b = 9.213 및 c = 9.153 Å33. 그림 1은 Li의 구조와 화학적 환경 (네 개의 O 원자와 4 면 체를 형성 하는)과 철 (사면체를 4 개의 O 원자와 함께 형성)을 보여줍니다. 에너지 최소화 계산은 평형 격자 상수를 얻기 위해 Li5FeO4의 소포 액 벌크 구조에 대해 수행 하였으며,이로 인해 본 연구에서 사용 된 쌍 전위의 품질에 대 한 평가 (실험과 비교를 통해)를 가능 하 게 한다. 계산 된 평형 격자 상수 (테이블 S1에서 표로 작성 됨)는 1% 오차 범위 내에서 실험과 잘 일치 합니다. 리, h. (2018).

Minimap2: 뉴클레오티드 서 열에 대 한 쌍별 정렬. 생물 정보학, 34:3094-3100. 도: 10.1093/생물 정보학/bty191 정의 목록은 DL 요소를 사용 하 여 작성 되며 일반적으로 일련의 용어/정의 쌍으로 구성 됩니다 (정의 목록은 다른 응용 프로그램을 가질 수 있지만).